بهره برداري بي‌رويه مردم از گياهان دارويي، معطر سمي، معطر و ... به‌صورت مستقيم از طبيعت عامل اصلي تخريب و انهدام پوشش گياهي و انقراض نسل بسياري از گونه‌ها مي‌باشد. از اين‌رو حفظ، حراست و احياء اين‌گونه‌ها از وظايف عمده و مهم بخش تحقيقات گياهان دارويي و معطر مي‌باشد. از اهداف اصلي اين بخش جمع‌آوري، شناسايي، كشت، اهلي كردن و در نهايت تعيين مواد مؤثره تعداد زيادي از گونه‌هاي بومي كشور مي‌باشد. بنابراين بخش مذكور تاكنون سعي در جمع‌آوري كليه گونه‌هاي مورد نظر نموده و امور به زراعي و به نژادي آن‌ها را مورد مطالعه و تحقيق قرار داده است. از اين‌رو با معرفي گونه‌هايي كه در شرايط ويژه داراي بيشترين ميزان ماده مؤثره هستند اقدام به ترويج و كاشت اين گياهان در سطح وسيع خواهند نمود تا بدينوسيله علاوه بر كاهش فشار از طبيعت گام‌هايي مثبت نيز در راستاي حفظ منابع برداشته شود.

گروه‌هاي تحقيقاتي بخش عبارتند از:

1- گروه تحقيقات جمع‌آوري و شناسايي

2- گروه تحقيقات شيمي گياهي

3- گروه تحقيقات كشت و اهلي كردن

    1-1. جمع‌آوري، شناسايي و بررسي تركيبات شيميايي، موضوع اين تحقيق   در قالب طرح ملي به اجرا گذاشته شده است و به دليل اهميت و تنوع در مصرف غذايي، دارويي، بهداشتي و آرايشي، تقريباً در همه كشورهاي جهان به‌خصوص در ايران مورد توجه مي‌باشند.
هدف از اجراي طرح شناسايي و جمع‌آوري، بررسي اكولوژيك و شرايط بوم شناختي آن‌ها است كه در نهايت به فراهم آوردن تسهيلات كشت و اهلي كردن آن‌ها جهت توليد انبوه توسط بخش‌‌هاي اجرايي و خصوصي كه با توجه به تقاضاي روز افزون بازار جهاني است منجر مي‌شود. زير طرح‌هاي اين طرح ملي در بعضي از استان‌هاي كشور از جمله مازندران، كرمان و اردبيل اجرا شده است.